Při velké povodni v roce 2002 byl pavilon šelem zcela zatopen. V rámci následné obnovy pavilonu byla přestavěna nevyhovující vstupní část budovy. Hlavní vstup byl zúžen a na získaném prostoru vznikla dvě nová terária. Ve větším z nich je umístěna vodní expozice s anakondami a rybami, neboť hadi dorostou délky až 7 m a hmotnosti 200 kg; 6 m široké okno do terária je z plexiskla. Menší terárium představuje expozici mexické pouště Sonory.
Vstupní průčelí domu je obloženo drátokošovou stěnou. Kámen obkladu je podobný původním masivním stěnám ve venkovních výbězích šelem. Vedle hlavního vstupu je na fasádě trychtýřovité kukátko do pouštního terária.
Obnova zbývající části budovy, veřejných wc a interiéru návštěvnického prostoru není řešena podle návrhu kanceláře D3A.